Từ 2001-2003 và một lần nữa từ 2012- (tháng 8) 2017, Coll-Seck đã từng là Bộ trưởng Bộ Y tế của Cộng hòa Sénégal.[1] Với tư cách là Bộ trưởng Bộ Y tế, bà đã khởi xướng cải cách sâu rộng ngành y tế ở Sénégal và tham gia vào một loạt các đối tác chính phủ, xã hội dân sự và khu vực tư nhân trong việc thực hiện và mở rộng các chương trình y tế công cộng. Bà đã huy động cam kết chính trị mạnh mẽ trong nước để sức khỏe được công nhận là chìa khóa cho sự phát triển kinh tế và xã hội, và bà đã huy động thành công các nguồn tài chính cả trong nước và từ các nhà tài trợ quốc tế song phương và đa phương.   [ <span title="This claim needs references to reliable sources. (January 2010)">cần dẫn nguồn</span> ]Từ năm 1996 đến 2001, Coll-Seck từng là Giám đốc của Chương trình Liên hợp quốc về HIV / AIDS (UNAIDS) tại trụ sở chính ở Geneva, Thụy Sĩ. Sử dụng các kỹ năng và kinh nghiệm của mình trong việc hoạch định chính sách và nghiên cứu khoa học, bà đã lãnh đạo Phòng Chính sách, Chiến lược và Nghiên cứu, bộ phận lớn nhất trong UNAIDS bao gồm một nhóm các bác sĩ, y tá, nhà nghiên cứu và các chuyên gia kỹ thuật và chính sách quốc tế khác. "Hướng dẫn hỗ trợ các chính phủ và xã hội dân sự trong việc gắn kết các phản ứng quốc gia và cộng đồng của họ với đại dịch AIDS toàn cầu. Awa Marie Coll-Seck sau đó được bổ nhiệm làm Giám đốc Bộ phận Hỗ trợ Khu vực và Quốc gia của UNAIDS, nơi bà phối hợp và huy động hệ thống của LHQ đối với dịch bệnh trong khi giám sát nhân viên UNAIDS phục vụ tại bốn văn phòng khu vực và tại các văn phòng cấp quốc gia ở Châu Phi, Châu Á, Đông và Trung Âu, và Mỹ Latinh và Caribê. Bà cũng từng là Uỷ viên trong Ủy ban của Tổng thư ký LHQ về HIV / AIDS và Quản trị ở Châu Phi.

Vào tháng 1 năm 2016, Coll-Seck được Tổng thư ký Liên Hợp Quốc Ban Ki-moon bổ nhiệm vào Nhóm tư vấn cấp cao cho mọi phụ nữ mọi trẻ em. [2] Cũng kể từ tháng 1 năm 2016, bà đã phục vụ trong Ủy ban Guttmacher - Lancet về Sức khỏe và Quyền sinh sản và Tình dục (SRHR).[3]